Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D3J9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D3J9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D3J9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D3J9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D3J9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D3J9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D3J9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D3J9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D3J9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D3J9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D3J9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D3J9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D3J9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D3J9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D3J9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D3J9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D3J9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D3J9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D3J9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D3J9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D3J9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D3J9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D3J9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D3J9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms