Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rasgef1cQ9D300 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms