Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms