Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms