Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chchd2Q9D1L0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms