Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms