Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C9

Rrp7a, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp7aQ9D1C9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp7aQ9D1C9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp7aQ9D1C9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp7aQ9D1C9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp7aQ9D1C9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp7aQ9D1C9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rrp7aQ9D1C9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrp7aQ9D1C9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms