Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D131 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D131 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D131 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D131 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D131 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D131 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D131 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Q9D131 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D131 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D131 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D131 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D131 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D131 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D131 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D131 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D131 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D131 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D131 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D131 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D131 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D131 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D131 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D131 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D131 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D131 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D131 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D131 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D131 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D131 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D131 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D131 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D131 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D131 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D131 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D131 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D131 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D131 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D131 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D131 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms