Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Hddc3Q9D114 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
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Hddc3Q9D114 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Hddc3Q9D114 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Hddc3Q9D114 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Hddc3Q9D114 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Hddc3Q9D114 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Hddc3Q9D114 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Hddc3Q9D114 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Hddc3Q9D114 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Hddc3Q9D114 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Hddc3Q9D114 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Hddc3Q9D114 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Hddc3Q9D114 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Hddc3Q9D114 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Hddc3Q9D114 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Hddc3Q9D114 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Hddc3Q9D114 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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Hddc3Q9D114 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms