Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms