Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snu13Q9D0T1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snu13Q9D0T1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms