Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I8

Mrto4, mRNA turnover protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrto4Q9D0I8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrto4Q9D0I8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrto4Q9D0I8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrto4Q9D0I8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrto4Q9D0I8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrto4Q9D0I8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrto4Q9D0I8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrto4Q9D0I8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrto4Q9D0I8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrto4Q9D0I8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrto4Q9D0I8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrto4Q9D0I8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrto4Q9D0I8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrto4Q9D0I8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrto4Q9D0I8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrto4Q9D0I8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrto4Q9D0I8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrto4Q9D0I8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrto4Q9D0I8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrto4Q9D0I8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms