Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx17Q9D0I4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx17Q9D0I4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms