Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mdm1Q9D067 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms