Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms