Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc18Q9CZJ9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc18Q9CZJ9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms