Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ91

Srfbp1, Serum response factor-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srfbp1Q9CZ91 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srfbp1Q9CZ91 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms