Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mis12Q9CY25 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms