Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx7Q9CY18 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms