Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufs4Q9CXZ1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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