Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Prdm5Q9CXE0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prdm5Q9CXE0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prdm5Q9CXE0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prdm5Q9CXE0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prdm5Q9CXE0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prdm5Q9CXE0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Prdm5Q9CXE0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Prdm5Q9CXE0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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