Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp23Q9CX11 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp23Q9CX11 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp23Q9CX11 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp23Q9CX11 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp23Q9CX11 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp23Q9CX11 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp23Q9CX11 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp23Q9CX11 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp23Q9CX11 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp23Q9CX11 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp23Q9CX11 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp23Q9CX11 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp23Q9CX11 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp23Q9CX11 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp23Q9CX11 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp23Q9CX11 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp23Q9CX11 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Utp23Q9CX11 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp23Q9CX11 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp23Q9CX11 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Utp23Q9CX11 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms