Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms