Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms