Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Khdc3Q9CWU5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms