Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CWU4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CWU4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CWU4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CWU4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms