Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms