Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx10Q9CWT3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms