Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms