Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms