Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR16

Ppid, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpidQ9CR16 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpidQ9CR16 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpidQ9CR16 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpidQ9CR16 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpidQ9CR16 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PpidQ9CR16 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms