Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms