Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN7

Mrpl41, 39S ribosomal protein L41, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl41Q9CQN7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl41Q9CQN7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl41Q9CQN7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms