Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Nicn1Q9CQM0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Nicn1Q9CQM0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Nicn1Q9CQM0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Nicn1Q9CQM0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Nicn1Q9CQM0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Nicn1Q9CQM0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nicn1Q9CQM0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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