Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms