Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed6Q9CQG0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed6Q9CQG0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed6Q9CQG0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed6Q9CQG0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed6Q9CQG0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed6Q9CQG0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed6Q9CQG0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed6Q9CQG0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms