Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl11Q9CQF0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl11Q9CQF0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms