Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms