Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Med4Q9CQA5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Med4Q9CQA5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Med4Q9CQA5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Med4Q9CQA5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Med4Q9CQA5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms