Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms