Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921530L21RikQ9CQ47 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms