Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms