Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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Chmp3Q9CQ10 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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Chmp3Q9CQ10 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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