Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc18Q9CQ07 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms