Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms