Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Prpf8Q99PV0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Prpf8Q99PV0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Prpf8Q99PV0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Prpf8Q99PV0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Prpf8Q99PV0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Prpf8Q99PV0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Prpf8Q99PV0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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