Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms