Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rassf3Q99P51 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rassf3Q99P51 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms