Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tsnaxip1Q99P25 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms