Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep41Q99NF3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms